SN/T 5203-2020 鱼类物种鉴定 基因条形码的检测技术规范.pdf
文档页数：12文档大小：3.94MB文档格式：pdfICS65.150 CCS C50 SN 中华人民共和国出入境检验检疫行业标准 SN/T5203—2020 鱼类物种鉴定基因条形码的检测 技术规范 Identification of fish species-Technical specification based on DNA barcoding 2020-12-30发布 2021-07-01实施 中华人民共和国海关总署发布 SN/T5203-2020 鱼类物种鉴定基因条形码的检测技术规范 1范围 本标文件定了鱼类基因条形码鉴定中的样品处理、基因扩增、序列分析、比对鉴定及结果判定 等操作程序和规范. 本文件适用于对自然环境种化产生的野生型鱼类或其残存的组织进行物种鉴定，不适合杂交选育 的品种. 2规范性引用文件 下列文件中的内容通过文中的规范性引用而构成本文件必不可少的条款.其中，注日期的引用文 件，仅该日期对应的版本适用于本文件；不注日期的引用文件，其最新版本（包括的修改单）适 用于本文件. GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法 3术语和定义 下列术语和定义适用于本文件. 3.1 基因条形码DNA barcoding 可用于物种鉴定的具有生物物种序列特征的DNA片段，本标准中专指鱼类线粒体基因组中COI 基因658bp的标准片段. 3.2 基因条形码鉴定技术DNA barcoding identification technique 一种利用基因片段进行生物物种鉴定和系统进化关系研究的技术，建立在基因扩增和序列比对 的基础之上，它具有不受物种发育状态、雌雄性个体及形态特征完整性与否的限制、减少对分类专家 的依赖、不受主观因素影响、准确率高、借助互联网可以实现数据共享等特点. 3.3 序列相似度similarity of the sequences 反映序列间相似程度的数值，一般以百分数表示. 3.4 FASTA格式FASTA format 生物信息学术语，又称Pearson格式，是一种用文本表示核苷酸序列或者氨基酸序列的格式.核 苷酸或者氨基酸碱基用单个字母表示，序列的第一行一般用“>”起始，随后可以添加序列名或者注 释，第二行为序列本身，只允许使用既定的核苷酸或者氨基酸编码符号，如核苷酸使用ATCG表示， 序列中不能出现回车等字符. 示例： >1 GTGTGTGGGTATGATTCTAAACTGACAAATCGCGCCTATTTATACTTTTTCCCCGGGGTTTAAATTCCTTGGCCCCCAT GTGGTTTCTTTAATTITAGATTGTGGAACCCATTTTCTTAATCCGTAATCG 1 SN/T5203—2020 4缩略语 下列缩略语适用于本文件. BOLD:生物条形码数据系统(barcoding of life datasystem)o 5试剂和材料 5.1水：...
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